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MSAP技术服务
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生物探索者    等级  

楼主 发表于  2016/8/15 10:26:30    编 辑   

MSAP技术服务


甲基化敏感扩增多态性,它是在扩增片段长度多态性技术的基础上建立起来的。MSAP技术相对其他测定DNA甲基化程度技术有如下优点:(1)不需知道被测DNA的序列信息,在不同生物上具有通用性,可用于DNA序列背景知识未知的生物。(2)操作相对简便,在AFLP技术体系的基础上不需要太大改进,即可操作。(3)可在全基因组范围检测CCGG位点的胞嘧啶甲基化变化。MSAP技术的局限性在于不能完成非CCGG位点的胞嘧啶甲基化。


MSAP的选择扩增产物目前主要通过两种方法进行分离检测,传统的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE的方法和自动化程度较高的毛细管凝胶电泳(FISH进行检测。

PAGE方法主要是优点是引物可以是普通引物,适用于少量样本或者大量样本的引物筛选比较合适,另外还可以对差异条带进行克隆测序,获得差异条带的序列信息。

毛细管电泳检测方法的优点是自动化,可以对大量样本进行实验,速度快,后期的条带读取可以依靠软件,降低了人为读取的标准不一。

1MSAP服务内容

1 样本基因组DNA的提取

2 筛选多态性较好的引物(酶切,预扩,选择性扩增)

3-1 ABI3730xl测序仪上完成数据采集

3-2 或是在JY-CX2B 测序电泳槽上完成PAGE 检测(可以回收差异带)

数据分析:和客户详细沟通,确认分析方案:读取01矩阵,PAGE胶建议客户自己读取;

2)客户提供:

 基因组DNA

至少15μL样品,浓度为50-100ng/μL

●2%琼脂糖电泳检测有DNA主带,没有降解;

●DNA经过DNA纯化试剂盒或磁珠纯化;

●DNA需溶解在TE或灭菌的去离子水里;

●DNA溶解后,肉眼看不到杂色;

植物材料: 新鲜组织,叶片采用硅胶干燥后或干冰运输;

动物材料: 新鲜组织,无水乙醇封存低温运输;

3)试验费用:


MSAP


按照96个样本进行随机8对引物计算,提供01矩阵;




[align=center]单价
数量
合计

DNA提取

30
96
2880

引物

300
0
0

酶切

40
192
7680

预扩

10
192
1920

选择性扩增

5
1536
7680

毛细管检测

800
16
12800

分析

2000
1
2000









29888

MSAP


按照25个样本进行随机8对引物计算,提供PAGE胶图




单价
数量
合计

DNA提取

30
25
750

纯化

10
25
250

酶切

40
50
2000

预扩

10
50
500

选择性扩增

5
400
2000

PAGE检测

800
8
6400

分析

2000
1
2000



13900
[/align]
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